过文彬

生物大数据分析实验室主任／博士生导师 · 华智种谷智创科技（浙江）有限公司

过文彬 2024.06 - 至今 华智种谷智创科技（浙江）有限公司生物大数据分析实验室主任，博士生导师，英国詹姆斯·赫顿研究所生物信息名誉研究员，国家级青年人才、丽水市B类引进人才、丽水“绿谷精英”人才。 2019.12 - 2024.05 英国詹姆斯·赫顿研究所生物信息学家，博士生导师（永久合同）。 2018.08 - 2019.11 英国邓迪大学生命科学院博士后。 2013.09 - 2014.09 英国邓迪大学科学与工程学院课程助教（Tutorial Assistant）。 2014.03 - 2018.10 邓迪大学（University of Dundee）生命科学院和詹姆斯·赫顿研究所（James Hutton Institute）联合培养博士（全额奖学金）。 2012.09 - 2013.11 邓迪大学科学与工程学院生物数学研究生（优秀毕业生，专业第一）。 2011.09 - 2012.05 邓迪大学与浙江工业大学大四3+1+1交换生（邓迪大学院长奖学金，专业第一）。 2008.09 - 2012.06 浙江工业大学理学院数学与应用数学本科生。 2023至今 作为博士生导师负责指导2名博士生，课题涵盖基于三代测序的转录组分析、通过机器学习和图像识别技术进行基因表型数据分析以及转录组大数据处理。 2018至今 在英国、德国、意大利、荷兰、澳大利亚、巴西等多个国家高校和研究机构开展转录组数据分析培训课程。 先后就职于英国邓迪大学、詹姆斯赫顿研究所及华智种谷智创科技（浙江）有限公司，拥有10年生物信息分析经验。长期致力于利用计算机和数学模型，原创开发基因大数据分析前沿方法，尤其在转录组方向的研究，处于世界领先水平。在《Nature》《Nature Genetics》《Nature Communications》等顶尖期刊发表30余篇学术论文，总引用1285次。主持或参与超20个项目，原创开发6种转录组组装、优化及基因表达分析的自动化软件，研究成果广泛应用于植物（如大麦、土豆、水稻、大豆、番茄、生菜等）、动物（如珊瑚鱼、鲑鱼、海鞘、南亚野鲮、蜜蜂等）及人类研究，获得超3000万元人民币科研经费，曾被苏格兰农作物研究学会授予最有价值年轻研究员Peter Massalski奖。主要成果包括：针对转录组作为基因功能研究关键工具的技术缺陷，开发了RTDBox转录组组装自动化软件，将组装准确率提升50%以上，基因功能数据库完善度提升2-5倍，已用于拟南芥、大麦、土豆、生菜、覆盆子等转录组分析，成为业内标杆；创新开发功能基因筛选自动化软件3D RNA-seq App，使无生物信息学基础的研究者也能进行专业转录组数据分析，这是目前唯一能够综合基因组、转录组和可变剪接分析的自动化软件，降低错误率并提高10%-50%的功能基因筛选效率，耗时从几周缩短至1-2小时，分析成本减少80%以上，该软件获邓迪大学2018年度创新奖，拥有95个国家和地区的20,000余名用户，并被中国、英国、德国、意大利、澳大利亚、巴西、泰国等国家多所高校和机构邀请开展培训课程高校与机构中开展培训课程，项目获苏格兰工商委员会和英国生物技术和生物科学研究委员会等重点支持，欲投资120万英镑（约1080万人民币），进行软件产业化孵化，被评价为最佳方案；开发的功能基因与差异表达基因网络调控模块已成功应用于拟南芥低温基因调控模块分析。此外，上述成果被广泛应用于人类疾病诊断、精准医疗、药物研发及单细胞转录组分析等领域，例如与英国国家医疗服务系统（NHS）合作，成功筛选出与罕见疾病相关的新目标基因及功能性可变剪接机制。