能源草多组学与蛋白质趋同演化
专题介绍
从能源草多组学资源到蛋白特征的趋同演化，本期关注工具如何服务具体科学问题。两场报告分别介绍EGDB与珍珠粟表观调控，以及蛋白语言模型支持的ACEP趋同分析，交流方法开发与应用中的判断。
专题背景
“科学进步依靠新技术、新发现和新思想，其重要顺序可能正是如此。”这句Sydney Brenner的名言指出了技术进步在推动科学突破中的重要性。本论坛将围绕“生物信息工具开发:历程与应用”这一主题，汇聚一线开发者，分享他们在开发尖端生物信息工具中的宝贵经验和多样化的应用场景。通过深入了解这些工具的原理和背后故事，生物学家们能够迅速将前沿技术应用到自己的研究中，从而大幅提升工作效率。此外，论坛还致力于提升对开发人员在科研界重要角色的认知。对于早期开发者，通过论坛可以了解到不同开发人员的职业发展轨迹，为职业发展规划提供参考。
主持人
浙江大学生命科学研究院 · 博士后
能源草多组学数据库的开发及珍珠粟的表观调控机制研究
福建农林大学 · 副教授／硕士生导师
jjxiao@fafu.edu.cn，毕业于中国科学院大学分子植物科学卓越创新中心，获得博士学位。随后在福建农林大学工作，现为副教授，硕士生导师。主要从事作物性状形成的遗传和调控机制研究。目前以第一或通讯（含共同）作者身份在iMeta、Nature Communications、Plant Biotechnology Journal、abiotech等杂志上发表多篇论文。
能源草因其高生物量产出和广泛的环境适应性，在可再生能源开发与生态治理中展现出巨大潜力。为推动相关基础研究，我们构建了能源草多组学数据库EGDB（Energy Grass Database），整合了11种能源草的基因组、转录组、表观组和表型数据，提供基因搜索、功能注释、顺式调控元件预测及CRISPR靶点设计等功能，为能源草的遗传改良和功能基因研究提供了一站式资源平台。在此基础上，本研究系统解析了珍珠粟的表观遗传调控机制。通过构建叶片的高分辨率表观修饰图谱，我们鉴定出超过25万个可及染色质区域、4.2万个活性增强子及6.8万个转录因子结合位点，为后续表观遗传编辑和性状精准操控奠定了基础。进一步的多组织多组学分析表明，根组织存在特异性的染色质开放区域，这些区域可被WRKY等转录因子识别，从而调控茉莉酸（JA）信号通路，参与根系发育及抗性形成等核心过程。CHH甲基化在根组织特异性表达基因的转录调控中表现出非典型的激活作用，突破了其传统作为沉默标记的认知。本研究首次在全基因组尺度揭示了表观修饰在基因表达调控和植物性状形成的核心调控，为珍珠粟及其他能源草的分子设计育种提供了新的理论依据与数据资源，将推动耐逆作物与能源草的可持续利用与改良。
已选择第 1 场：能源草多组学数据库的开发及珍珠粟的表观调控机制研究，肖嘉靖
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