CGM 第74期：全基因组变异图谱揭示甜瓜驯化历史及农艺性状形成基因位点

甜瓜是一种被广泛栽培的世界性园艺作物，有着悠久的栽培历史。由于非洲存在着大量的甜瓜近缘种，且有着与甜瓜一样的染色体数目，因此研究人员认为甜瓜起源并驯化于非洲。然而，通过基因组数据分析发现，与甜瓜亲缘关系最近的近缘种不是存在于非洲，而是在印度和澳大利亚。因此，关于甜瓜的驯化历史一直存在争议。 甜瓜按照子房绒毛的多少和长短分为厚皮甜瓜（C. melo subsp melo）和薄皮甜瓜（C. melo subsp agrestis）两个亚种。然而它们之间的驯化遗传基础仍不清晰。同时，作为一个多样性异常丰富的物种，与甜瓜农艺性状相关的基因位点报道很少。 本研究收集了来自世界50多个国家和地区的1184份甜瓜近缘种、野生种及栽培种进行了全基因组重测序，构建了甜瓜的全基因组变异图谱，通过进化树、群体结构、PCA等分析揭示甜瓜的3次驯化历史，并针对两次重要的驯化事件中的关键驯化性状的遗传基础进行了研究，为驯化假说提供证据。同时，通过全基因组关联分析，定位到200余个与甜瓜果实产量、品质、形态等16个重要农艺性状相关的基因（位点）。