CGM 第62期:你所不知道的甘蓝型油菜简史
菜籽油、芜菁甘蓝和西伯利亚羽衣甘蓝,如何联系到同一种作物的历史?报告结合群体测序与表达分析,追踪甘蓝型油菜的起源和形态分化。
安宏
安宏本科毕业于华中农业大学植物科学技术专业,后在傅廷栋教授课题组攻读博士并于 2016 年获得作物遗传育种博士学位;此后在密苏里大学 J. Chris Pires 实验室从事博士后研究。
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当人们走进超市看到货架上摆放的菜籽油、芜菁甘蓝和西伯利亚羽衣甘蓝,很少有人会知道它们其实是同一个物种:甘蓝型油菜,它们是由我们经常食用的另外两种蔬菜白菜和甘蓝自然杂交形成的异源四倍体植物。
本研究对183个甘蓝型油菜品种和174个其可能的亲本品种进行了转录组和GSS测序。通过对数据进行分析,我们发现甘蓝型油菜存在6个不同的亚群,并利用系统发生树研究了甘蓝型油菜内、以及甘蓝型油菜与其亲本之间的进化关系。最后,我们通过对不同形态类型亚群形成过程中选择性消除和差异表达基因的分析,检测到一些对甘蓝型油菜多样化过程有重要作用的潜在基因。
我们的研究对甘蓝型油菜的起源和多样化过程提供了新的观点,也揭示了多倍体植物进化的复杂性。
参考文献
- Hong An, Xinshuai Qi, Michelle L Gaynor, Yue Hao, Sarah C Gebken, Makenzie E Mabry, Alex C McAlvay, Graham R Teakle, Gavin C Conant, Michael S Barker, Tingdong Fu, Bin Yi, J Chris Pires. Transcriptome and organellar sequencing highlights the complex origin and diversification of allotetraploid Brassica napus. Nature communications. 2019;10(1):2878. DOI: 10.1038/s41467-019-10757-1
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