CGM第565期：克隆性造血的人类血浆蛋白质组学特征
麻省总医院、哈佛医学院 · 医学助理教授
于秩是麻省总医院和哈佛医学院医学助理教授。研究主要涉及对人类多组学数据（包括体细胞和生殖系DNA突变、单细胞和群体RNA、血浆蛋白）的计算建模，旨在研究心血管疾病及其他与衰老相关疾病的机制和预防治疗手段。独立前为Broad Institute of MIT and Harvard的博士后研究员。2017-2020年在约翰斯霍普金斯大学攻读博士学位，此前在哈佛大学和香港浸会大学分别完成硕士和本科学位。于European Heart Journal, Circulation, Nature Methods, Nature Genetics等杂志发表论文70余篇；获得STAT Wunderkinds, 美国国家人类基因组研究所 (NHGRI) K99/R00, 美国肾病学会杂志最佳文章, 国家优自奖等一些奖项。
潜定克隆性造血（CHIP）是一种与年龄相关的现象，与多种癌症及非癌症结局（尤其是冠状动脉疾病）密切相关。为了探索CHIP影响下游临床结局的机制，本研究利用来自5个TOPMed队列和UK Biobank队列共61,833名参与者的全基因组/全外显子测序及配对血浆蛋白质组学数据（分别通过SomaScan和Olink平台测定），系统性地描绘了CHIP的蛋白质组学特征 。研究识别了与CHIP及常见驱动基因（DNMT3A, TET2, ASXL1, JAK2）显著相关的数百种血浆蛋白。结果显示，这些关联在不同驱动基因、性别和种族间表现出显著的异质性，并主要富集于免疫反应和炎症通路 。通过孟德尔随机化分析以及造血细胞Tet2缺失小鼠模型的ELISA实验验证，我们解析了CHIP导致的因果性蛋白质组扰动（例如，证实了TET2突变对LCN2和MPO水平的因果影响）。
此外，本研究还识别了CHIP与CAD之间共享的血浆蛋白通路 。这项迄今为止规模最大的人类CHIP血浆蛋白质组学研究，为理解CHIP如何通过特定的分子通路影响疾病表型提供了重要的机制见解 。
参考文献
- Zhi Yu, Amélie Vromman, Ngoc Quynh H. Nguyen, Art Schuermans, Linke Li, Thiago Rentz, Tetsushi Nakao, Shamsudheen K. Vellarikkal, Md Mesbah Uddin, Abhishek Niroula, Gabriel Griffin, Michael C. Honigberg, Amy E. Lin, Christopher J. Gibson, Daniel H. Katz, Usman A. Tahir, Shi Fang, Jacqueline S. Dron, Michael Pan, Sara Haidermota, Shriienidhie Ganesh, Tajmara Antoine, Joshua Weinstock, Thomas R. Austin, Ramachandran S. Vasan, Gina M. Peloso, Whitney Hornsby, Peter Ganz, JoAnn E. Manson, Bernhard Haring, Charles Kooperberg, Alexander P. Reiner, Joshua C. Bis, Bruce M. Psaty, Yuan-I Min, Adolfo Correa, Leslie A. Lange, Wendy S. Post, Jerome I. Rotter, Stephen S. Rich, James G. Wilson, Benjamin L. Ebert, Bing Yu, Christie M. Ballantyne, Josef Coresh, Vijay G. Sankaran, Alexander G. Bick, Siddhartha Jaiswal, Robert E. Gerszten, NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine, Usman A. Tahir, Robert E. Gerszten, Peter Libby, Rajat M. Gupta, Pradeep Natarajan. Human plasma proteomic profile of clonal hematopoiesis. Nature Communications. 2025;16(1):11688. DOI: 10.1038/s41467-025-66755-z
评论（0）
登录后即可发表评论。
登录暂无评论，来发表第一条评论吧！