杨柳科地理分布、系统关系与亚基因组演化图谱

CGM第537期:古杂交多倍化驱动杨柳属的物种辐射分化

杨树和柳树的多样化与古老的异源多倍化有什么关系?本期结合祖先核型、转录组及表观数据,讨论两个亚基因组的不同演化轨迹及其与性状创新的联系。
王德彦
王德彦

四川大学生命科学学院 · 博士

2018-2025年硕博连读毕业于四川大学生命科学学院,师从马涛教授。主要以杨柳科植物为研究对象,通过整合多组学数据解析该科的性染色体多样化与性别决定机制,揭示基因组演化历史及环境适应的分子基础。相关研究成果以第一或共一作者发表于Nature Communications、Genome Biology和Molecular Biology and Evolution等期刊。

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多倍化在被子植物中广泛存在,是促进植物创新性状起源、适应性辐射和物种多样化的重要动力。异源多倍体通过不同谱系的杂交和染色体加倍形成,长期被认为具有更高的生态适应性和进化潜力。然而,识别早期异源多倍化事件,并阐明特异亚基因组演化在适应性创新起源及物种辐射中的作用,仍面临巨大挑战。广义杨柳科(Salicaceae)作为木本植物研究的模式系统,包含三个亚科约56个属。我们报道了这一类群中的代表性基因组,并收集了相应的表观遗传和转录组数据。通过祖先核型重建及系统基因组学分析,确定了该科完整的11条祖先染色体,揭示了杨属(Populus)和柳属(Salix)及其姊妹属—山桐子属(Idesia)和栀子皮属(Itoa)起源于约58百万年前的一次古老异源多倍化事件,其中一个亲本谱系可能已经灭绝。随后,两个亚基因组经历了差异化的核型和演化轨迹,这一特异演化过程促进了杨属和柳属中开花物候以及小而多毛种子等性状的起源,并可能推动了它们的生态适应与物种辐射。研究强调了古老异源多倍化及特异亚基因组演化在植物生命之树深层分支上驱动性状创新与物种多样化的关键作用。

参考文献

  1. Deyan Wang, Mengmeng Li, Wenlu Yang, Kai Chen, Jiale Zhao, Lanxing Shan, Pengchuan Sun, Li Xu, Zhiqiang Lu, Yiling Li, Yang Chen, Jiaxiao Xie, Yubo Wang, Heng Huang, Ao Feng, Xiaoning Hao, Tiannan Luo, Jianglin Luo, Yuanzhong Jiang, Quanjun Hu, Zhenxiang Xi, Jianquan Liu, Matthew Olson, Tao Ma. Ancient allopolyploidy and specific subgenomic evolution drove the radiation of poplars and willows. Nature Communications. 2025;16(1):6881. DOI: 10.1038/s41467-025-62178-y

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