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CGM 第46期:稻田杂草之首稗草与水稻相争的*秘密武器*

稗草怎样在稻田中与水稻竞争并抵御病原?报告从基因组中的次生代谢基因簇入手,介绍化感物质产生及其与稻田环境适应的关系。
邱杰

Visiting scholar in Ken Olsen’s Lab at Washington University in St. Louis

稗草被认为是全球最严重的杂草之一,也是稻田杂草之首,严重影响水稻产量。化感是水稻和杂草互作的主要方式之一。长期以来,我们大多从单方向了解水稻如何与稗草进行竞争,但反过来对于稗草如何抑制水稻生长,形成竞争优势的基因组机制却知之甚少。我们对六倍体稗草(Echinochloa crus-galli)基因组进行测序获得其草图,研究发现稗草基因组中存在可以合成化感物质丁布(DIMBOA)的三个基因簇拷贝。在稗草与水稻混种时,该基因簇会快速启动合成丁布并抑制水稻生长。同时,稗草还进化出目前仅在水稻基因组中发现的稻壳素(momilactone)基因簇,并发现稻瘟菌可以诱导其大量表达。该基因簇可能被稗草用于抵御真菌等病菌,从而使其更好地适应稻田环境。

参考文献

  1. Guo L#, Qiu J#, Ye C, Jin G, Mao L, Zhang H, Yang X, Peng Q, Wang Y, Jia L, et al. 2017. Echinochloa crus-galli genome analysis provides insight into its adaptation and invasiveness as a weed. Nat. Commun. 8:1031.

  2. Qiu J#, Zhou Y#, Mao L, Ye C, Wang W, Zhang J, Yu Y, Fu F, Wang Y, Qian F, et al. 2017. Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication. Nat. Commun. 8:15323.

  3. Guo L#, Qiu J#, Li L-F, Lu B, Olsen K, Fan L. 2018. Genomic Clues for Crop–Weed Interactions and Evolution. Trends Plant Sci. 23:1102–1115.

  4. #: 共同一作

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