
CGM 第162期: 新型 CRISPR/Cas13 RNA 编辑系统的挖掘与改造
不可培养微生物的宏基因组能提供怎样的新型RNA工具?报告追踪Cas13X和Cas13Y的发现与工程改造,连接计算挖掘、实验验证和RNA编辑工具开发。
胥春龙
中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 · 博士后
博士,2011年毕业于江西农业大学,2018于中国农业大学获得博士学位,2015-2017年分别在美国俄勒冈健康与科学大学和斯隆-凯特琳癌症研究中心进行研究生联合培养,目前在中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心灵长类疾病模型研究组进行博士后研究,研究方向为基因编辑工具开发与应用。
活动回放
CRISPR/Cas13被广泛地应用于RNA单碱基编辑和核酸检测领域(比如新冠病毒检测),之前发现的Cas13系统都是从可培养的微生物基因组数据中挖掘的, 然而自然界中90%的微生物都不可培养。本研究通过精巧的计算生物学算法和实验设计,对不可培养的微生物大规模宏基因组数据进行计算分析,鉴定到了两个新的Cas13家族, 并命名为Cas13X和Cas13Y。最后, 通过一系列工程化改造开发了一套高效率和高特异性的RNA编辑工具, 对开发基于RNA编辑的基因治疗手段具有重要的促进作用。
参考文献
Chunlong Xu et al, Programmable RNA editing with compact CRISPR-Cas13 systems from uncultivated microbes. Nature Methods, 2021
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