
CGM 第158期: 有丝分裂后神经细胞内的DNA损伤和修复
不再进行DNA复制的神经细胞,如何维持长期的基因组稳定?报告介绍SAR-seq与ddN S1-END-seq,探查内源损伤的位置、类型及修复过程,为研究神经细胞衰老提供方法视角。
吴薇博士
2012年毕业于华中科技大学,2017年于中国科学院生物物理研究所获得生信博士学位,师从陈润生院士,目前在美国癌症研究中心André Nussenzweig(美国医学院院士)课题组进行博士后研究,研究方向主要为DNA损伤修复。
活动回放
神经细胞是人体内寿命最长的有丝分裂后体细胞, 它们不进行DNA复制,只能依靠DNA修复机制来维持基因组保真度。这些修复机制随着年龄的增长而下降,可以导致基因组功能受损,引起认知能力下降和神经退行性疾病。然而目前对于神经细胞的基因组不稳定性以及是如何进行修复的知识仍然非常有限。我们开发了两个高通量测序技术SAR-seq和ddN S1-END-seq来对神经细胞的内源性DNA损伤及修复过程进行检测,来研究几个问题:神经细胞内源的DNA损伤在基因组上什么位置,损伤的类型是什么,是如何被修复的以及来源。
参考文献
- Wei Wu, Sarah E Kargbo-Hill, William J Nathan, Jacob Paiano, Elsa Callen, Dongpeng Wang, Kenta Shinoda, Niek van Wietmarschen, Jennifer M Colón-Mercado, Dali Zong, Raffaella De Pace, Han-Yu Shih, Steve Coon, Maia Parsadanian, Raphael Pavani, Hana Hanzlikova, Solji Park, Seol Kyoung Jung, Peter J McHugh, Andres Canela, Chongyi Chen, Rafael Casellas, Keith W Caldecott, Michael E Ward, André Nussenzweig, André Nussenzweig. Neuronal enhancers are hotspots for DNA single-strand break repair. Nature. 2021;593(7859):440-444. DOI: 10.1038/s41586-021-03468-5
(# 共同一作;* 共同通讯作者)
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