
CGM 第113期: 玉米干旱响应的遗传变异解析
玉米遗传差异如何通过基因表达影响干旱响应?研究比较多份自交系在不同供水条件下的转录组,用 eQTL 和孟德尔随机化分析连接变异、表达与抗旱性。
刘升学
博士,讲师,2006和2009年在山东农业大学获学士和硕士学位;2014年在中国科学院大学获博士学位;2014至2017年在中国科学院植物研究所从事研究工作;2017年任中国农业大学讲师。
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在世界范围内,干旱是导致玉米产量损失的主要因素。解析抗旱性的分子机制和克隆控制抗旱性的关键基因一直是植物抗逆分子生物学研究的热点。研究表明,生物体许多性状的改变,是由于基因表达的改变导致的。为了更好地揭示遗传变异对基因表达的调控作用,以及它们与抗旱性间的关系。我们选择了224份抗旱性存在广泛差异的玉米自交系,在正常浇水和两种干旱胁迫条件下,共获得了627个高质量转录组数据,进行了eQTL和孟德尔随机化分析,相关研究成果于2020年7月6日在线发表于《基因组生物学》(Genome Biology)期刊。
参考文献
Liu S, Li C, Wang H, Wang S, Yang S, Liu X, Yan J, Li B, Beatty M, Zastrow-Hayes G, Song S, Qin F (2020) Mapping regulatory variants controlling gene expression in drought response and tolerance in maize. Genome Biol 21 (1):163.
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