CGM 第112期:转座子依赖宿主基因转录的多样转座策略主题封面

CGM 第112期:转座子依赖宿主基因转录的多样转座策略

转座子怎样找到插入基因组的位置?跨物种比较揭示部分转座子的整合与转录起始密切相关,为理解插入偏好及其演化影响提供线索。
张新岩

2007年本科毕业于中国农业大学,先后在北京大学和普渡大学进行博士训练和博士后研究,现为中国农业科学院深圳农业基因组研究员。

转座子作为基因组生态系统中的寄生性角色,是基因组的重要组成部分。转座子活动对于塑造真核生物基因组有非常大的贡献,是基因、基因家族和基因组演化的重要驱动力,为自然选择提供丰富的变异。多数转座子并非随机地插入宿主基因组中,而是通过采取各异的靶向策略进行基因组整合,表现出不同的插入位点分布。报告人比较分析了真核生物多个物种中活跃转座子的整合位点,发现一些转座子的基因组整合位点与宿主基因转录密切相关。Mutator和P转座酶分别在玉米和果蝇基因组中具有精准靶向RNA聚合酶II转录起始位点的能力,具备天然的“精准导航系统”。

参考文献

  1. Zhang, X., et al., Transposable elements employ distinct integration strategies with respect to transcriptional landscapes in eukaryotic genomes. Nucleic Acids Res, 2020. 48(12): p. 6685-6698.

评论(0

登录后即可发表评论。

登录

暂无评论,来发表第一条评论吧!