Genomics Communications 2025年创刊发布会与作者分享会

随着高通量长读测序技术的进步和高效基因组组装算法的发展，基因组学领域已构建了许多高质量的基因组组装。这些基因组资源为识别基因组变异（如单核苷酸多态性、小插入缺失和结构变异）提供了良好的基础。然而，从多个基因组中识别同源基因及其相关变异的过程相对繁琐。为了简化这一过程，我们开发了一套集成多功能的工具包Homotools，旨在辅助搜索同源基因、发现注释变异，并将基因序列的结构变化可视化。这套工具适用于任何物种的基因组研究，用户只需提供已组装的基因组及相关的注释数据。在实际应用中，通过分析玉米自交系的基因组，发现了除草剂硝磺草酮耐受性相关的ben1基因的多个变异，其中包括转座子插入的结构变异。有些结构变异极有可能导致基因功能的变化，并影响植物对除草剂的抗性。Homotools的分析结果可以直接帮助设计进一步的验证实验。这个报告会简单介绍Homotools的功能模块和应用实例。