噬菌体基因组重设计流程

CGM第605期:ΦX174 基因组与蛋白质组的全面诱变

当每个核苷酸和氨基酸都被逐一改变,哪些损伤最难被解释?以ΦX174为完整实验系统,报告检验蛋白质相互作用、结构模型与AI预测之间的差距。
魏会金
魏会金

基因组调控中心(Centre for Genomic Regulation,CRG) · 博士研究生

2020—2023年在浙江大学爱丁堡大学联合学院(ZJE)攻读硕士,2023—2025年在Wellcome Sanger Institute任研究助理。2025—2029年为基因组调控中心(CRG)博士培养计划。

本次报告将介绍近期针对具有重要历史意义的模式系统(噬菌体 ΦX174)开展的工作《Complete Mutagenesis of the Genome and Proteome of ΦX174》。作者对 ΦX174 基因组和蛋白质组进行了系统性饱和突变分析,发现约一半的核苷酸突变和超过 60% 的氨基酸突变会降低适应度,其中破坏蛋白质相互作用界面是最主要的机制。借此数据集,发现当前先进人工智能模型对突变效应的预测仍有限,但结合结构建模可提供机制解释;这一完整生物系统的全面突变分析也定量揭示了我们目前理解和预测分子生物学的能力边界。

原文研究示意图

参考文献

  1. Huijin Wei, Xianghua Li, Ben Lehner. Complete Mutagenesis of the Genome and Proteome of ΦX174. bioRxiv. 2026. DOI: 10.64898/2026.07.25.740675

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