香蕉基因组组装和群体结构比较

CGM第587期:T2T基因组解析芸薹属着丝粒动态演化

着丝粒怎样在近缘作物间保持功能又快速变化?报告汇集芸薹属着丝粒资源,分析其组成、多样性及动态演化,为比较染色体结构提供线索。
陈为凯
陈为凯

北京大学现代农业研究院 · 副研究员

中国农业大学博士,长期从事蔬菜等园艺作物的基因组学研究,并同时开展着丝粒遗传多样性研究。研究对象主要包括十字花科芸薹属,以及茄科番茄和烟草等园艺植物。先后主持国自然青年科学基金、山东省自然青年科学基金和潍坊市鸢都学者项目。目前以第一作者(含共同)身份在Nature Genetics、Nature Plants(2篇)、Nature Communications和Horticulture Research等期刊发表学术论文10余篇。

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着丝粒是真核生物细胞分裂中保障染色体精准分离的核心结构。尽管其功能高度保守,但其序列却表现出极快的演化速度,这一现象被称为“着丝粒悖论”。由于着丝粒区域充斥着高度重复的序列,长期以来受技术限制难以完整组装,成为了解开其演化谜题的主要瓶颈。

本研究聚焦于重要的芸薹属(Brassica)作物,其中白菜(B. rapa)是我国栽培面积最大的蔬菜,涵盖芜菁、大白菜和小白菜等不同形态的亚种。研究团队利用最新的三代测序技术,成功构建了7个白菜亚种(AA)、1个芥菜型油菜(AABB)和1个甘蓝型油菜(AACC)的T2T或近T2T基因组。在此基础上,结合已发表的芸薹属T2T基因组开展了大规模的泛着丝粒研究,从单一基因组(福田大白菜)、泛基因组(PanA)和比较基因组(A/B/C)等3个层次进行着丝粒的结构解析及遗传多样性分析,首次系统揭示了芸薹属种内和种间的着丝粒演化规律与多样性机制,解开了芸薹属作物的着丝粒快速进化之谜。这也是该团队继烟草、番茄等着丝粒解析之后,在植物着丝粒领域的又一项重要成果,为破解“着丝粒悖论”提供了关键证据。

原文研究示意图

参考文献

  1. Weikai Chen, Jingxuan Wang, Shaoying Chen, Dian Meng, Yu Mu, Hui Feng, Lugang Zhang, Li Guo. Pan-centromere landscape and dynamic evolution in Brassica plants. Nature Plants. 2025;11(11):2240-2253. DOI: 10.1038/s41477-025-02131-5

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