CGM第579期：月季泛基因组揭示广泛的遗传多样性与重要观赏性状解析

月季是重要的经济型观赏植物，广泛应用于切花生产、园林绿化及香料化妆品等产业。虽然月季及其野生近缘种等蔷薇亚属资源为新品种的培育提供了宝贵的材料，然而其普遍存在基因组杂合度高、倍性复杂、种间差异大等问题，严重制约了对关键性状遗传机制的解析与优良基因的高效利用。本研究从头组装23份代表性材料的高质量基因组，并结合3个已发表基因组，构建了包含55个单倍型解析的蔷薇亚属泛基因组，系统揭示了蔷薇亚属丰富的遗传变异图谱。基因组比较分析表明，不同组间存在广泛的基因渐渗，为远缘杂交利用提供了遗传基础。泛基因组分析鉴定了1,801,537个结构变异，并解析了持续开花、重瓣性及花瓣变色等重要园艺性状的遗传基础，鉴定CCD4同源基因为调控花瓣褪色的关键因子。进一步通过对异源多倍体Rosa gallica和三倍体Rosa hybrida ‘La France’的亚基因组分析，解析了现代月季重要育种材料的杂交起源。该研究为揭示月季基因组演化、挖掘重要性状调控机制及推动分子设计育种提供了重要理论依据和基因组资源。