甜玉米果穗多样性与群体结构

CGM第566期:甜玉米风味复杂性的遗传基础

甜玉米好吃是否只取决于含糖量?报告将感官评价与代谢物、表达和遗传变异联系起来,拆解甜味、香气与口感的共同贡献,并通过基因验证探索品质改良的切入点。
李坤
李坤

广东农业科学院作物研究所 · 副研究员

博士,广东农业科学院作物研究所副研究员,2019年获得华中农业大学博士学位(导师严建兵教授)。主要从事鲜食玉米起源与进化、重要品质性状的关键基因挖掘与功能解析、生物育种技术开发等相关研究。目前以第一或通讯作者(含共同)在Nature Genetics、Plant Biotechnology Journal、The Plant Journal等期刊发表论文10余篇,获授权发明专利7件。

甜玉米作为全球重要的粮蔬果作物,其风味品质的遗传改良一直是育种家的核心目标。然而,与普通玉米相比,甜玉米的风味形成机制,特别是除甜度外的口感背后的遗传调控网络尚不清楚。

为此,本研究首先组装了一个高质量的超甜玉米参考基因组,并对全球295份甜玉米自交系进行了重测序。通过群体遗传学分析,我们发现甜玉米与普通玉米之间存在显著的遗传分化,其驯化选择信号不仅集中在碳水化合物代谢通路上,还涉及众多激素响应与发育调控基因。为了系统解析甜玉米风味,本研究整合了多组学数据:对280份材料的籽粒进行了转录组测序,并对20天的授粉籽粒进行了代谢组学分析,鉴定出近500种结构已知的代谢物。通过代谢物全基因组关联分析,我们定位了101个显著位点。更重要的是,我们结合感官评价,发现风味评分与特定的糖类、有机酸及挥发物高度相关。研究的关键发现是,除了已知的主效基因Sh2和Su1外,我们鉴定并验证了三个全新基因的功能。利用CRISPR技术敲除这些基因,我们证实了它们对目标代谢物的调控作用,并发现了能够协调高产与优质的自然变异位点。

该研究不仅构建了首个甜玉米风味预测模型,还直接验证了三个可用于精准设计育种的新基因。研究证明,通过优化果皮厚度等口感性状,即使不显著增加糖度,也能提升消费者的整体风味感知,为打破高产与优质之间的矛盾提供了可行的遗传路径。

原文研究示意图

参考文献

  1. Kun Li, Yongtao Yu, Shijuan Yan, Wenqiang Li, Jieting Xu, Gaoke Li, Wu Li, Jianhua Liu, Xitao Qi, Wenjie Huang, Qunjie Zhang, Qian Kong, Yingni Xiao, Nan Zhang, Jingyun Luo, Lu Chen, Liying Feng, Wenguang Zhu, Tianxiang Wen, Lihua Xie, Yuliang Li, Wenjia Lu, Chunyan Li, Songtao Gui, Yingjie Xiao, Ning Yang, Lin Zhuo, Alisdair R. Fernie, Hai-Jun Liu, Jianguang Hu, Jianbing Yan. Genetic basis of flavor complexity in sweet corn. Nature Genetics. 2025;57(11):2842-2851. DOI: 10.1038/s41588-025-02401-0

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