核心与非核心蛋白结构域参与植物登陆和多样化的示意图

CGM第551期:蛋白结构域在植物中的演化

植物在登陆前后如何重组蛋白质的“功能积木”?本期比较446个植物基因组,讨论核心结构域的获得与丢失,以及新结构域组合如何参与植物多样化。
杨程傲
杨程傲

南京农业大学 · 博士研究生

本科毕业于山东农业大学,现为南京农业大学博士研究生,师从薛佳宇副教授和Yves Van de Peer 教授。主要研究方向包括陆地植物演化、被子植物核型演化,以及药用植物代谢通路中关键酶的挖掘等相关领域。以第一作者或共同作者在 Cell Genomics、Journal of Genetics and Genomics 等期刊发表研究论文2篇。

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蛋白质结构域可以理解为“功能积木”,决定了蛋白质能做什么。本研究利用446个来自不同植物类群的基因组,对所有蛋白质结构域及其组合进行了全面分析。我们发现,陆地植物拥有比藻类更多的结构域类型和结构域组合。

在植物从水生走向陆地的早期阶段,链形植物祖先获得了大量新的“核心”结构域,这些新的功能模块极大丰富了它们的遗传工具箱,使得植物能够从单细胞进化到多细胞,并逐渐适应陆地环境。有趣的是,当植物真正成功登陆后,这些早期获得的“核心”结构域数量开始逐渐减少;与此相反,植物不断获取新的“非核心”结构域,并且结构域之间的重新组合(即结构域“拼搭”)变得更加频繁,产生了大量全新的蛋白质,推动了植物多样性的扩展。

我们由此提出:在生物进化中失去一些原有的遗传元素并不一定是坏事。核心结构域的减少可能反而降低了植物的进化束缚,让它们能更自由地创新、灵活应对不断变化的环境、产生新物种。

参考文献

  1. Jia-Yu Xue, Cheng-Ao Yang, Shuaiya Hu, Hai-Yun Fan, Yan-Mei Zhang, Zhu-Qing Shao, Linzhou Li, Sibo Wang, Tong Wei, Shanshan Dong, Yang Liu, Zhen Li, Yves Van de Peer. Evolution of protein domains and protein domain combinations provides insights into the origin and diversification of land plants. Cell Genomics. 2026;6(4):101107. DOI: 10.1016/j.xgen.2025.101107

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