CGM第490期:基于贝叶斯节点测年法和石化生灭模型对被子植物起源时间的新见解
化石与分子序列为何会给出不同的被子植物起源时间?报告比较贝叶斯节点定年和石化生灭模型,讨论数据与模型如何影响冠群年龄估计,以及这些时间框架对植物演化研究的意义。
马小雅
南京师范大学生命科学学院 · 博士后
合作导师为钟伯坚教授。主要研究方向为植物系统发育与植物多样性。相关研究成果以第一作者(含共同)发表于Nature Communications (2篇),Genome Biology and Evolution等期刊,获批国家资助博士后研究人员计划及江苏省卓越博士后研究计划。
被子植物起源时间至今仍争议不断(白垩纪至二叠纪)。近年来,分子钟方法的快速发展为解决这一难题提供了新的契机,尤其是贝叶斯框架下的石化生灭模型(Fossilized Birth-Death Model)明确将现存物种与化石记录纳入同一宏观演化过程,打破了传统节点定年法依赖最古老化石作为单一校准点的局限,在分子数据和地层化石记录之间建立了动态关联。然而,该方法尚未在被子植物起源演化时间的研究中得到应用和评估。研究利用大规模的现存物种及化石记录重建被子植物的演化时间轴,聚焦两个核心问题:1)被子植物冠群年龄的长期争论;2)石化生灭模型和传统节点定年法在推断物种分化时间上的差异性。研究结果揭示了不同数据集推断的被子植物冠群年龄差异的主要原因,强调了石化生灭模型在估算时间上具有更强的稳健性。此外,该研究构建了可靠的被子植物起源演化时间轴,为探讨被子植物关键性状的起源演化及如何在陆地环境中占据主导地位提供了时间框架。
参考文献
- Xiaoya Ma, Chi Zhang, Lingxiao Yang, S. Blair Hedges, Bojian Zhong. New insights on angiosperm crown age based on Bayesian node dating and skyline fossilized birth-death approaches. Nature Communications. 2025;16(1):2265. DOI: 10.1038/s41467-025-57687-9
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