CGM 第40期：迈向真核生物泛基因组学

一个物种所包含的所有基因的集合被称为泛基因组（pan-genome）。泛基因组研究主要关注两个方面：核心基因组（core genome）以及非必需基因组（dispensable/distributed genome）。核心基因组指的是该物种所有个体都包含的基因，表征该物种生长发育等不可或缺的功能。非必需基因组指的是仅在部分个体中存在的基因，它们与个体对外界环境的适应息息相关。自从2005年泛基因组的概念被提出以来，泛基因组分析便被广泛应用于微生物基因组研究中。直到近年来，泛基因组分析才被零星地应用于真核生物（主要是农作物）的基因组研究中。我将以3000水稻基因组测序项目为例，介绍真核生物泛基因组分析的特点、可行性方法以及其意义与应用。

Reference for this talk:

Wang W, Mauleon R, Hu Z , et al. Nature 2018

Hu Z , Wang W, et al. Scientific Data 2018

Hu Z , Sun C, et al. Bioinformatics 2017

Sun C, Hu Z , et al. Nucleic Acids Research 2016