
CGM第390期:利用深度突变扫描(DMS)构建完整的KRAS变构抑制位点图谱
KRAS 的变构抑制位点能否被完整地画出来?报告用深度突变扫描构建 KRAS 与六个相关蛋白的变构抑制图谱。

翁晨春
西班牙基因组调控研究中心
博士,现为西班牙基因组调控研究中心(Centre for genomic regulation, CRG)Ben Lehner课题组博士后。主要从事生物大分子变构调控与高通量定量生物学研究。 翁博士本科就读于中国科学技术大学生命科学学院,博士就读于中国科学技术大学生命科学学院光寿红教授课题组,研究方向为秀丽隐杆线虫中非编码小RNA的生成与功能。2020年至今在Ben Lehner课题组做博士后研究。
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在 Bilibili 打开完整回放 ↗KRAS在大约10%的癌症中发生体细胞突变,包括约90%的胰腺癌、约40%的结直肠癌、约35%的肺癌和约20%的多发性骨髓瘤。KRAS在GDP结合的失活状态与GTP结合的激活状态之间转换,并在GTP结合的激活状态传递激活信号给下游通路。在超过四十年的被定义为原癌基因的研究历史中,有上万篇文献与超过300个相关的KRAS结构解析,但直到2021年才出现了第一个FDA批准的KRAS(G12C) 的抑制剂Sotorasib。Sotorasib通过共价结合KRAS(G12C), 从而将KRAS(G12C) 蛋白稳定在GDP结合的失活状态,抑制KRAS通路。这种变构抑制剂的出现证明了探索KRAS和众多难以成药的靶点的变构抑制的可行性。然而和众多重要的药物靶点一样,KRAS变构抑制剂的研发也受限于缺少有效的已知变构抑制位点。绘制完整的KRAS变构抑制位点图谱会极大地加速KRAS变构抑制剂的研发。
翁博士利用深度突变扫描(DMS)绘制了完整的KRAS与六个相关蛋白的变构抑制图谱,为KRAS的抑制剂开发与发展提供了可靠实用的数据集。大量的变构抑制数据也加深了对蛋白的变构抑制机制的理解,同时提供了一个绘制变构抑制图谱的经济可行的高通量方法。
参考文献
- Weng Chenchun, Faure Andre J., Escobedo Albert, Lehner Ben. The energetic and allosteric landscape for KRAS inhibition. Nature. 2024;626(7999):643-652. DOI: 10.1038/s41586-023-06954-0
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