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CGM 第30期:量化基因座间基因转换的系统发育学方法

介绍量化位点间基因转换的系统发育建模方法,并以酵母核糖体蛋白基因家族为例,评估基因转换对重复基因进化的贡献。
汲翔

Department of Biomath, University of California, Los Angeles

位点间基因转换(IGC)会使重复基因趋于一致。尽管基因组中常含有大量重复序列,IGC 对进化的影响仍因统计工具不足而难以量化。本报告介绍将 IGC 纳入常用序列变化概率模型的系统发育建模方法,并在 14 组酵母核糖体蛋白基因中估算由 IGC 而非点突变产生的密码子替换比例。结果显示该比例约为 20% 至 38%,支持 IGC 在这些基因家族进化中发挥重要作用。

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