CGM 第209期：FarmGTEx项目介绍
家养动物的性状关联位点，如何通过分子表型发挥作用？报告介绍FarmGTEx项目，以基因表达等分子QTL连接遗传变异与经济性状，讨论跨组织数据对功能解析和育种研究的价值。
房灵昭
2019.01-至今 英国 爱丁堡大学 人类遗传中心; 2017.02-2019.01 美国 马里兰大学和 USDA-ARS 定量遗传学和生物信息学 博士后; 2013.03-2017.05 丹麦 奥胡斯大学和中国农业大学定量遗传学和生物信息学 博士
在过去的十几年里，全基因组关联分析（GWAS）为我们揭示了大量影响复杂性状和疾病的遗传变异位点。然而，这些位点大多数落在了基因组的调控区域，影响了下游分子机制的解析。因此，需要我们从系统遗传学（system/integrative genetics）的角度去研究遗传变异是如何通过调控一系列中间分子表型（基因表达，可变剪切，蛋白，代谢物和微生物），从而影响最终表型 （复杂性状或疾病）。Farm animal Genotype-Tissue Expression (FarmGTEx) 项目致力于通过全球科学家的合作，为家养动物构建一个全面的分子表型QTL数据库，从而帮助我们更好地解析重要经济性状以及环境适应性的分子遗传机制，同时促进新的育种手段（比如基因编辑）和比较基因组学的发展。
参考文献
- Lingzhao Fang, Jinyan Teng, Qing Lin, Zhonghao Bai, Shuli Liu, Dailu Guan, Bingjie Li, Yahui Gao, Yali Hou, Mian Gong, Zhangyuan Pan, Ying Yu, Emily L Clark, Jacqueline Smith, Konrad Rawlik, Ruidong Xiang, Amanda J Chamberlain, Michael E Goddard, Mathew Littlejohn, Greger Larson, David E MacHugh, John F O'Grady, Peter Sørensen, Goutam Sahana, Mogens Sandø Lund, Zhihua Jiang, Xiangchun Pan, Wentao Gong, Haihan Zhang, Xi He, Yuebo Zhang, Ning Gao, Jun He, Guoqiang Yi, Yuwen Liu, Zhonglin Tang, Pengju Zhao, Yang Zhou, Liangliang Fu, Xiao Wang, Dan Hao, Lei Liu, Siqian Chen, Robert S Young, Xia Shen, Charley Xia, Hao Cheng, Li Ma, John B Cole, Ransom L Baldwin, Cong-Jun Li, Curtis P Van Tassell, Benjamin D Rosen, Nayan Bhowmik, Joan Lunney, Wansheng Liu, Leluo Guan, Xin Zhao, Eveline M Ibeagha-Awemu, Yonglun Luo, Lin Lin, Oriol Canela-Xandri, Martijn F L Derks, Richard P M A Crooijmans, Marta Gòdia, Ole Madsen, Martien A M Groenen, James E Koltes, Christopher K Tuggle, Fiona M McCarthy, Dominique Rocha, Elisabetta Giuffra, Marcel Amills, Alex Clop, Maria Ballester, Gwenola Tosser-Klopp, Jing Li, Chao Fang, Ming Fang, Qishan Wang, Zhuocheng Hou, Qin Wang, Fuping Zhao, Lin Jiang, Guiping Zhao, Zhengkui Zhou, Rong Zhou, Hehe Liu, Juan Deng, Long Jin, Mingzhou Li, Delin Mo, Xiaohong Liu, Yaosheng Chen, Xiaolong Yuan, Jiaqi Li, Shuhong Zhao, Yi Zhang, Xiangdong Ding, Dongxiao Sun, Hui-Zeng Sun, Cong Li, Yu Wang, Yu Jiang, Dongdong Wu, Wenwen Wang, Xinzhong Fan, Qin Zhang, Kui Li, Hao Zhang, Ning Yang, Xiaoxiang Hu, Wen Huang, Jiuzhou Song, Yang Wu, Jian Yang, Weiwei Wu, Claudia Kasper, Xinfeng Liu, Xiaofei Yu, Leilei Cui, Xiang Zhou, Seyoung Kim, Wei Li, Hae Kyung Im, Edward S Buckler, Bing Ren, Michael C Schatz, Jingyi Jessica Li, Abraham A Palmer, Laurent Frantz, Huaijun Zhou, Zhe Zhang, George E Liu, . The Farm Animal Genotype-Tissue Expression (FarmGTEx) Project. Nature genetics. 2025;57(4):786-796. DOI: 10.1038/s41588-025-02121-5
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