CGM 第194期:绞股蓝染色体水平基因组组装及绞股蓝皂苷生物合成调控网络简析

绞股蓝是葫芦科植物中具有较高经济价值的药用植物，其主要药效成分为绞股蓝皂苷，与人参、三七中的主要活性成分结构相似，均为达玛烷型四环三萜皂苷，因此也有“南方人参”的美誉。绞股蓝基因组图谱的缺乏制约了其功能基因组学和分子育种的发展。

近期本课题组组装了高质量的绞股蓝基因组，组装得到的绞股蓝基因组大小为582Mb，contig N50为1.71Mb, scaffold N50为50.78Mb。该基因组包含59.14%的重复序列，并从中预测到了25,285个蛋白质编码基因。通过来自七个组织的转录组数据，利用组织特异性基因共表达分析重建了绞股蓝苷生物合成途径和潜在的调控网络。鉴定到4个UDP-葡萄糖醛酸转移酶(UGTs)形成一个基因簇，可能参与催化绞股蓝苷生物合成中的糖基化反应，同时也鉴定到了一系列的候选转录因子，为进一步研究绞股蓝皂苷生物合成调控机制奠定了基础。