CGM 第108期：SARS-Cov-2 的系统发育树构建
病毒系统树能否可靠地指向起源地？这项基于早期 SARS-CoV-2 序列的分析说明，信息位点不足与建树随机性会限制对分化顺序的判断。
内容简介
对GISAID数据库中的新型冠状病毒序列（截至2020-05-14）进行了系统发育以及BEAST 分子钟树构建，并以网站形式于 covid19tree.org 进行展示。结果表明，该病毒树的基部呈星状，没有足够的信息位点确认各分支的分化顺序。单凭序列信息，无法确定其起源地。分析中的随机因素可能会导致不同的国家或地区被置于树基部。
参考文献
- Benoit Morel, Pierre Barbera, Lucas Czech, Ben Bettisworth, Lukas Hübner, Sarah Lutteropp, Dora Serdari, Evangelia-Georgia Kostaki, Ioannis Mamais, Alexey M Kozlov, Pavlos Pavlidis, Dimitrios Paraskevis, Alexandros Stamatakis. Phylogenetic Analysis of SARS-CoV-2 Data Is Difficult. Molecular biology and evolution. 2021;38(5):1777-1791. DOI: 10.1093/molbev/msaa314
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